임상의학 연구자, 보다 쉽고 빠르게 R 데이터 분석에
입문하기 원하는 연구자들을 위한 필독서 !
이 책의 목표는 독자들에게 R을 보다 효과적으로, 빠른 시간 내에 익히고 실무에서 활용할 수 있도록 안내하는 것이다. 이에 기본적 원론적 내용은 줄이고, 연구자들에게 실질적 도움을 줄 수 있는 R의 유용한 기능들을 소개하고 최대한 현실을 반영하는 임상데이터를 이용하여 실습을 수행하였다. 아울러 R의 다양한 기능과 문법에 대해서는 실습 중간중간 설명 및 예제를 최대한 담아 독자들의 이해를 돕고자 하였다.
Contents
Ch 1 R 시작하기
1 임상연구 및 빅데이터 사용에 유용한 R
2 R 및 RStudio 설치하기
3 RStudio 구성, 환경설정
4 R 필수 개념 이해
5 데이터 인덱싱과 슬라이싱
6 예제 데이터 다운로드 및 저장
7 패키지
8 R 나도 할 수 있다 !
Ch 2 데이터 분석의 시작
1 프로젝트 기반으로 시작하기
2 데이터 불러오기
3 데이터 훑어보기
4 데이터 인덱싱, 슬라이싱
5 factor 다루기
6 기술통계
7 데이터 수정 및 결측치
8 apply 함수
9 if, for 함수
10 중복 결과값 다루기
11 Table 1 만들기
Ch 4 데이터 분리와 합치기
1 merge
2 tidyverse를 이용한 merge
3 tidy 데이터
Ch 5 데이터 시각화
1 R base 그래프
2 ggplot2 패키지
3 ggplot2의 다양한 옵션
4 ggpubr 패키지
5 상관관계를 그려주는 패키지
Ch 6 임상연구 관련 의학통계
1 회귀분석
2 일반화 선형분석
3 ROC 관련 분석
4 생존분석
5 시간의존 콕스 비례위험모형
Ch 7 연구 따라하기 1: 아스피린과 간담도암
1 연구 배경 및 개요
2 분석 계획
3 데이터 분석
4 단변량 분석
5 다변량 분석
6 결과 제시
Ch 8 연구 따라하기 2: 생체표지자와 간암
1 연구 배경 및 개요
2 분석 계획
3 데이터 분석
4 ROC 곡선
5 Cut-Off
Ch 9 연구 따라하기 3 : ALT 정상화와 간암 발생 위험
1 연구 배경 및 개요
2 분석 계획
3 데이터 전처리 및 탐색
4 데이터 분석: 기저특성 요약
5 데이터 분석: 간암 발생
6 데이터 분석: ALT 정상화
7 데이터 분석: 간암 발생의 위험인자 찾기
8 데이터 분석: 하위그룹 분석
하나의 테이블로 제시하기
Author
최종기
서울아산병원 소화기내과에서 환자를 보는 의사이다. 내과 전공의시절 임상연구를 처음 접하였고, 메이오 클릭닉(Mayo Clinic)에서 리서치 펠로우를 하면서 본격적으로 데이터사이언스, 빅데이터 임상연구에 관심을 가지게 되었다. R을 배우면서 그 재미와 매력에 빠지게 되었고, 주변 의사들에게 널리 알리기 위해 유튜브 강의(임상연구를 위한 R program 교육)도 개설하였다. R을 이용하여 간질환 환자 진료에 도움이 되는 임상연구를 계속하는 것이 꿈이다.
서울아산병원 소화기내과에서 환자를 보는 의사이다. 내과 전공의시절 임상연구를 처음 접하였고, 메이오 클릭닉(Mayo Clinic)에서 리서치 펠로우를 하면서 본격적으로 데이터사이언스, 빅데이터 임상연구에 관심을 가지게 되었다. R을 배우면서 그 재미와 매력에 빠지게 되었고, 주변 의사들에게 널리 알리기 위해 유튜브 강의(임상연구를 위한 R program 교육)도 개설하였다. R을 이용하여 간질환 환자 진료에 도움이 되는 임상연구를 계속하는 것이 꿈이다.