유전체 데이터 분석 1

기초편
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Publication Date 2023/04/03
Pages/Weight/Size 190*260*35mm
ISBN 9791159433931
Categories 대학교재 > 의약학/간호 계열
Description
『유전체 데이터 분석』은 바이오 데이터의 단순 활용 목적을 넘어 바이오 데이터 그 자체와 그 ‘생로병사’의 생명주기를 탐구대상으로 삼는 ‘데이터 과학’적 관점을 취한다. 이 책은 바이오 정보학의 필요성을 느끼지만 접근에는 어려움을 느낀 생명과학자, 의학자, 통계학자, 전산학자, 공학자 그리고 바이오정보학 분야의 새내기 입문자를 위한 책이다. 실습 코드 및 데이터는 USB 메모리에 담겨 책자와 함께 제공되며, 유튜브 채널을 통한 동영상 실습강좌도 함께 제공된다.
Contents
서문 2

PART 01
생명의 정보학 BIOINFORMATICS OF LIFE
CHAPTER 01 | 생명의 정보학 11
CHAPTER 02 | 바이오 빅데이터와 개인 유전체 시대의 개막 28
CHAPTER 03 | 질병 유전체와 개인 유전체 데이터의 해석 46
CHAPTER 04 | 약물 유전체학 60
CHAPTER 05 | 유전체 분석 신기술 75
CHAPTER 06 | 바이오뱅크 89

PART 02
생명의 정보 네트워크 NETWORK BIOLOGY AND NETWORK MEDICINE
CHAPTER 07 | 모티프, 온톨로지, 패스웨이, 네트워크 분석 109
CHAPTER 08 | 인공지능 신약개발 125
CHAPTER 09 | 염기서열 모티프와 유전자 발현 조절 분석 138
CHAPTER 10 | 유전자 온톨로지와 생물학적 패스웨이 분석 174
CHAPTER 11 | 생물학적 네트워크 분석 200

PART 03
RNA 기능유전체학 TRANSCRIPTOMICS AND FUNCTIONAL GENOMICS
CHAPTER 12 | 마이크로어레이 데이터와 유전체 발현 분석의 이해 219
CHAPTER 13 | 마이크로 RNA 데이터 분석의 이해 238
CHAPTER 14 | non-coding RNA 데이터 분석의 이해 249
CHAPTER 15 | 유전체 발현 데이터 분석 실습 270
CHAPTER 16 | 유전자 온톨로지와 생물학적 패스웨이 지식의 활용 299
CHAPTER 17 | 유전자집합 분석과 예후아군의 예측 320
CHAPTER 18 | 마이크로 RNA 발현 분석 344

PART 04
DNA 유전체 변이형과 표현형 분석 SNPS, GWAS AND CNVS, INFORMATICS FOR GENOMIC VARIANTS
CHAPTER 19 | 인간 유전체 다형성의 이해 363
CHAPTER 20 | 유전체 다형성, GWAS와 PRS 분석 378
CHAPTER 21 | 희귀질환 유전체 데이터 분석 393
CHAPTER 22 | 농업, 육종, 그리고 데이터 406
CHAPTER 23 | SNP과 약물유전체 데이터베이스 활용 416
CHAPTER 24 | 전장유전체 연관분석 실습 431
CHAPTER 25 | 복제수변이 데이터 분석 449

PART 05
메타유전체 및 후성유전체 데이터 분석 METAGENOME AND EPIGENOME, BASIC DATA ANALYSIS
CHAPTER 26 | 후성유전체학 467
CHAPTER 27 | 마이크로바이옴과 메타유전체 478
CHAPTER 28 | 마이크로바이옴 데이터 분석 491
CHAPTER 29 | 후성유전체 데이터베이스 및 분석 도구 518
CHAPTER 30 | 후성유전체 데이터 분석 534

부록 553
A R을 이용한 기초 데이터 분석 연습 555
B Virtualbox 설치 588

글을 마치며 600
Author
김주한,이계화,김태민,김도균,김동섭,한미령,최선심,이채영,최무림,강양제,이영희,노미나