1 클로닝이란? 1
1.1? 클로닝의 정의 2
1.2? 새로운 유전자의 발굴 3
1.3? 과거의 클로닝 5
1.4? 현재의 클로닝 6
2 클로닝을 위한 준비 9
2.1? 클로닝 설계에 유용한 소프트웨어 10
2.2? 벡터, 플라스미드, 컨스트럭트 & 코작 염기서열(Kozak consensus sequence) 13
2.3? MCS(Multiple Cloning Site) 18
2.4? 제한효소(Restriction Enzyme, RE)와 스타활성(star activity) 22
2.5? 아가로즈 젤 전기영동을 이용한 DNA 분석 29
2.6? LB(Luria-Bertani) 플레이트 만들기 34
2.7? Competent Cell 37
2.8? DNA의 질량을 mole 수로 바꾸는 법 41
2.9? 새로운 플라스미드를 받았을 때 42
2.10? cDNA 라이브러리 44
3 클로닝 첫걸음 47
3.1? Cut & Paste 48
3.2? DNA 염기서열분석 & direct 염기서열분석 61
3.3? 클로닝을 위한 PCR & nested PCR 65
3.4? Fill-in(Full & Partial) 77
3.5? 상보적인 점착말단(Compatible Cohesive End) 83
3.6? 메틸화(Methylation) 85
3.7? 세 절편 연결(Three-piece ligation) 93
3.8? 위치지정 돌연변이(Site-directed mutagenesis) 96
3.9? TA 클로닝 & T-벡터의 제작 102
3.10? TOPO TA 클로닝 108
3.11? Gateway 클로닝 110
3.12? 식물 형질전환(Plant transformation) 벡터의 구조 114
3.13? Rhizobium radiobacter 형질전환 117
4 클로닝 다음 걸음 119
4.1? 유전자 중간 부분에 다른 DNA를 삽입(insertion)하는 방법 120
4.2? 유전자 중간 부분을 삭제(deletion)하는 방법 124
4.3? 유전자에 에피톱 택을 삽입하는 방법 & CRISPR/Cas9 126
4.4? 번역융합(Translational Fusion) vs 전사융합(Transcriptional Fusion) 133
5 클로닝으로 인한 두통을 덜어주는 방법 135
5.1? Golden gate assembly & Golden gate를 이용해 푸는 직소퍼즐 136
5.2? In-Fusion SLIC(In-Fusion Sequence-and Ligation-Independent Cloning) 142
5.3?? T4 DNA Pol SLIC
(T4 DNA Polymerase Sequence-and Ligation-Independent Cloning) 153
5.4? RE-free SLIC 159
5.5? EMP(Exponential Megapriming PCR) 클로닝 161
5.6? MRF(Modified Restriction Free) 클로닝 165
5.7? Non-template PCR 클로닝 168
5.8? cDNA 합성 의뢰 171
6 클로닝 마지막 걸음 173
6.1? 다른 종에서 유사한 유전자(homolog)를 클로닝하는 방법 174
6.2? RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends) 178
6.3? BAC 재조합 181
6.4? Old Trick: 부분절단 185
6.5? 벡터의 변경 187
6.6? 클로닝이 다 됐다고 생각했는데 틀이동 돌연변이가 있을 때 191
6.7? 클로닝의 실제: 억세게 운이 없는 경우 193
7 클로너에게 주는 조언 205
7.1? 클로닝이 안 될 때 206
7.2? 클로닝의 정리와 기록 209