첫 번째 사신과의 대결 후 평화로운 나날을 보내고 있는 하리와 친구들. 하지만 전 세계에 의문의 전염병이 퍼지고, 이것이 또 다른 사신과 연관이 있음을 알게 된 아이들은 세계를 구하기 위해 다시 싸움을 시작한다! 한편 정체불명의 공격으로 힘을 잃어버린 주비는 신비아파트에 머물게 되고, 강림은 알 수 없는 이유로 하리를 떠나 사라지고 만다. 그리고 하리에게 비밀을 지닌 리온이 다가오는데.... 과연 하리와 친구들은 더욱 강력해진 사신을 물리치고 세상을 구할 수 있을까?